Проект Днестр-II (2006-2007) получил поддержку Агентства по охране окружающей среды Швеции (SEPA) и является частью инициативы «Окружающая среда и безопасность» (ENVSEC). Проект реализовывался ОБСЕ и ЕЭК ООН при сотрудничестве с органами власти и неправительственными организациями Республики Молдова и Украины. ЮНЕП/GRID-Арендал предоставил поддержку в реализации компонента проекта по информационному менеджменту. Результатами проекта стали следующие документы:

1. Программа действий по усовершенствованию трансграничного сотрудничества и устойчивого управления бассейном реки Днестр. Результаты проекта (публикация)
2. Программа действий по усовершенствованию трансграничного сотрудничества и устойчивого управления бассейна реки Днестр на период 2007-2010 гг. заложила основу для двухстороннего сотрудничества и управления бассейном реки. Поддержка Программе действий и разделению обязанностей при ее выполнении была выражена в письмах от агентства «Апеле Молдовей», Министерства экологии и природных ресурсов Республики Молдова, Государственного комитета Украины по водному хозяйству, Государственной гидрометеорологической службы Украины и Министерства охраны окружающей природной среды Украины
3. Проект Соглашения о сотрудничестве в области охраны и устойчивого развития бассейна реки Днестр (версия 12 марта 2007 г.)  определяет принципы и направления сотрудничества, руководящие принципы и стандарты, рассматривает вопросы предотвращения и контроля загрязнения вод, распределения водных ресурсов, регулирование стока вод, сохранения биоразнообразия, защиты и сохранения среды Черного моря, чрезвычайных ситуаций, мониторинга и оценки состояния окружающей среды, обмена данными, участии общественности и т.д. Соглашение предусматривает создание Комиссии по устойчивому использованию и охране бассейна р. Днестр.
4. Проект Положения об участии общественности в деятельности Днестровской комиссии и принятии решений, касающихся состояния бассейна реки Днестр (версия ноября 2006 г.) устанавливает детальную процедуру участия общественности в работе Днестровской комиссии, образование которой предусмотрено в рамках нового Соглашения по бассейну р. Днестр.
5. Регламент по обеспечению участия заинтересованных лиц в деятельности института Уполномоченных в рамках Соглашения между правительством Республики Молдова и правительством Украины о совместном использовании и охране пограничных вод (2007). Задачей документа является совершенствование участия заинтересованных лиц в обсуждении вопросов и принятии решений, входящих в компетенцию Уполномоченных в рамках Соглашения 1994 г. Документ основан на принципах конвенции ЕЭК ООН «О доступе к информации, участию общественности в процессе принятия решений и доступе к правосудию по вопросам, касающимся окружающей среды» (Орхусская конвенция) и определяет механизмы доступа к информации и участия заинтересованных лиц в принятии решений, относящихся к бассейну р. Днестр.

6. Проект Регламента cотрудничества по санитарно-эпидемиологическому контролю качества вод на трансграничном молдово-украинском участке бассейна Днестра и трансграничных рек черноморского бассейна (версия мая 2007 г.). Разработка этого регламента была инициирована Одесской областной санитарно-эпидемиологической службой и Министерством здравоохранения Молдовы. Задачей документа является возобновление (после распада Советского Союза) молдавско-украинского сотрудничества по вопросам санитарно-эпидемиологического контроля качества вод. В документе изложена программа и методы  систематического мониторинга, а также правила функционирования рабочей группы.

7. Регламент украинско-молдавского сотрудничества по управлению совместным веб-сайтом бассейна реки Днестр (2007).  Документ определяет процедуру регулярного обновления содержимого веб-сайта бассейна реки Днестр.

Ниже представлены отчеты проектных встреч.

1. Отчет по 1-ой встрече проекта (Киев 10-11 августа 2006 г.)
2. Отчет по 2-ой встрече проекта (Одесса 22-24 сентября 2006 г.)
3. Отчет по 3-ей встрече проекта (Кишинев 8-9 ноября 2006 г.)
4. Отчет по 4-ой встрече проекта (Черновцы 23-24 февраля 2007 г.)
5. Отчет по 5-ой, заключительной, встрече проекта (Кишинев 12-13 июня 2007 г.)